Vốn tư liệu gồm nhiều ấn phẩm chuyên ngành Y, tạp chí (ngoại văn, tiếng Việt); CD ROM, VCD giải phẫu, Sản khoa, Vi sinh, ngoại ngữ...; Luận văn tốt nghiệp sau đại học, bác sĩ.
Từ năm 1999 đến nay Thư viện đã được các Tổ chức quốc tế:
o CIDMEF (Conférence Internationale des Doyens et des Facultés de Médecine d'Expression Française);
o CIUF (Conseil InterUniversitaire de la Communauté Française de Belgique) thông qua CUD (Commission Universitaire pour le Dévelopement.
viện trợ nhiều sách y khoa, nhiều máy tính, nhiều thiết bị tin học khác và tháng 10/2008 sẽ mở cửa phòng đọc nguồn mở phục vụ độc giả.
Tháng 01/2008 Thủ tướng Chính phủ đã ký quyết định đổi tên thành Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch vì thế tên Thư viện hiện nay là Thư viện Trường Đại học khoa Phạm Ngọc Thạch.
