NGHIÊN CỨU SỰ ÐA DẠNG DI TRUYỀN Ở MÌ CAO SU (MANIHOT GLAZIOVII MUEL-ARG) VÀ MỘT SỐ GIỐNG TRỒNG KHOAI MÌ (MANIHOT ESCULENTA CRANTZ)

Phan Ngô Hoang, Bùi Trang Việt, Hoàng Kim^*

Trường Ðại học Khoa học Tự Nhiên - ÐHQG tp.HCM

* Trung tâm nghiên cứu Nông nghiệp Hưng Lộc- Viện KHKT NN miền Nam

Tóm tắt:

          Trong bài này, kỹ thuật PCR-RAPD được sử dụng để nghiên cứu mối quan hệ giữa các loài và giống trồng của Manihot: Manihot glaziovii và một số giống trồng Manihot esculenta (Nền co, Cuống trầu, Sắn xanh, Chuối vàng). DNA được trích từ mô sẹo lá. Ba mươi mồi nhân tạo được sử dụng để phát hiện các nhóm kiểu gen của Manihot. Các băng được điện di phân tích để đánh giá khoảng cách di truyền giữa các loài và xây dựng cây phả hệ. Việc phân tích quần thể di truyền đựơc thực hiện nhờ chương trình Popgen 32 (phiên bản 1.31). Kết quả cho thấy kỹ thuật PCR-RAPD tiện ích cho việc phân biệt những loài và giống trồng.

Từ khoá: Manihot esculenta, M. glaziovii, mô sẹo, PCR-RAPD, đa dạng di truyền, khoảng cách di truyền.

STUDY ON GENETIC DIVERSITY OF MANIHOT GLAZIOVII

AND SOME CULTIVARS OF CASSAVA

(MANIHOT ESCULENTA CRANTZ)

Phan Ngo Hoang, Bui Trang Viet, Hoang Kim^*

University of Natural Sciences - VNU.HCM

* Hung Loc Agricultural Research Center - Institute of Agricultural Sciences of South Vietnam

Abstract:

          In this paper, the PCR-RAPD (polymerase chain reaction / Random Amplified Polymorphic DNA) technique was employed to investigate phylogenetic relationships between species and cultivars of the genus Manihot: Manihot glaziovii and some common cultivars of Manihot esculenta (Nen co, Cuong trau, Xanh, Chuoi vang). DNA was extracted from leaf-derived calli. Thirty synthetic oligonucleotide primers were used to generate patterns from groups of genotypes of the genus. The degree of band sharing was used to evaluate genetic distances between species and to construct a phylogenetic tree. Population genetic analysis was performed by Popgene 32 version 1.31 (website at: http://www.ualberta.ca/~fyeh/). It was concluded that this PCR-RAPD technique could be useful for distinguishing these species and cultivars.

Keywords: Manihot esculenta, M. glaziovii, calli, PCR-RAPD, genetic diversity, genetic distance